Возможно, причина неожиданного «опустошения» и такого же странного «заполнения» Эрцо кроется в том, что озеро напрямую связано с целой сетью подземных карстовых пещер Кавказа и, соответственно, с огромными подземными водоемами? Известно, что части карстовых пещер постоянно изменяются — растут и разрушаются гипсовые и солевые наплывы, преображая рельеф и создавая естественные преграды для подземных вод. Скорее всего, в какой-то момент перегородки, созданные самой природой, рушатся и воды Эрцо уходят туда же, откуда потом возвратятся — в великое подземное царство Кавказа.