В 2001 году Яковлева была удостоена Государственной премии за роль Марии Стюарт. В том же году ей было присвоено звание народной артистки России. Среди последних крупных ролей Елены Яковлевой в театре — роль хромоножки Лебядкиной в «Бесах» и Кабанихи в «Грозе». Кстати, впервые на роль матери Кабановой взята не пожилая актриса внушительных габаритов, а актриса возраста и комплекции Елены Алексеевны. Ее игра вызвала самые положительные отзывы даже у тех, кому спектакль в целом не понравился. Актрису приглашали сниматься на Запад, в Штаты, но она отказалась. Во-первых, недостаточно хорошо знает английский, а во-вторых, отношение у Яковлевой к американскому образу жизни скептическое: «В жизни по их нормам — идиотскому стремлению к здоровому образу жизни, когда все резко начинают худеть или пить много воды, чтобы моча была прозрачной, — ничего хорошего нет. Массовый идиотизм отрицает индивидуальность».
Как уже было сказано, родители Елены Яковлевой и ее брат живут в Харькове, и она часто посещает Первую столицу. Была она и на праздновании 350-летия города, в очередной раз призналась в любви к нему, сказала, что Харьков стал больше и чище, вспомнила о первой любви, первых свиданиях. На Салтовке, где актриса провела свою юность, она посадила дерево на местной «аллее звезд». Кстати, когда-то на концерте в Харькове Елена Яковлева пообещала, что каждый харьковчанин сможет пройти в «Современник» на постановки с ее участием бесплатно. Впрочем, если будут просить деньги — платите, жалеть, скорее всего, не придется.